燃料电池公司成立于2020年4月，由研究院引进新加坡淡马锡理工学院先进氢能技术及研究团队联合创建，为研究院全资子公司，注册资本4500万元。燃料电池公司致力于轻型高功率密度氢燃料电池系统、高端波纹板、膜电极等关键零部件与材料的研发、产业化与国产化，并实现氢源产品开发，获批重庆市新型研发机构资质。其核心团队掌握氢燃料电池设计核心技术，拥有7项国际发明专利，在风冷电堆领域处于国内领先地位，并荣获2020年重庆英才创新创业示范团队。燃料电池公司在氢燃料电池系统及其关键部件国产化上做到了性能更优越、成本更低廉，其自主研究开发的波纹板成本降低了50%，已实现国产替代；金属双极板PVD涂层工艺替代了镀金，成本降低超过70%，膜电极产品性能优越，成本更具优势。成功开发了多个型号的超轻空冷式燃料电池电源系统，相比同类产品，重量减轻77%，可靠性提升51%，成本降低55%。成功开发国内续航时间最长的氢燃料电池无人机，并与新加坡、德国、日本等多地客户达成合作，正重点围绕无人机、邮政物流车、船舶等多个领域开展产业化应用。已建成投用燃料电池半自动化生产线，预计实现产值1000万元以上。